二次隔離就是實(shí)驗(yàn)室和外界之間的隔離，是以防止實(shí)驗(yàn)室外的人被敢染為目的的。污染傳播的主要途徑是氣溶膠的擴(kuò)散和對(duì)病原體的直接接觸。特別是前者，僅僅靠改善操作方式是不能解決的，一般采取在隔離區(qū)和維持區(qū)之間建立氣壓差和對(duì)排風(fēng)進(jìn)行滅菌（fungus)處理兩種方法。

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隔離區(qū)（PⅢ實(shí)驗(yàn)（experiment)室）應(yīng)維持壓差（負(fù)壓）一般為-20～-50Pa，使維持區(qū)到隔離區(qū)造成定向氣流。實(shí)驗(yàn)室集中供氣實(shí)驗(yàn)室的很多設(shè)備的運(yùn)行都需要各種各樣的氣體供應(yīng)，同時(shí)也會(huì)產(chǎn)生廢氣。如何既安全又方便地解決供排氣問(wèn)題，也是一直以來(lái)困擾實(shí)驗(yàn)室工作人員的問(wèn)題之一。傳統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)室供氣方式是采用將氣瓶安置在儀器設(shè)備的旁邊，危險(xiǎn)氣體的氣瓶放置在氣瓶柜內(nèi)。

空調(diào)系統(tǒng)必須可靠運(yùn)行，采用先進(jìn)的技術(shù)，合理利用和節(jié)省能源和資源，保證環(huán)境的質(zhì)量和安全，為實(shí)驗(yàn)者提供必要的溫度和濕度，確保在安全條件下進(jìn)行生物實(shí)驗(yàn)，以保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。同時(shí)，必須控制實(shí)驗(yàn)室的清潔度，過(guò)濾新鮮空氣，使實(shí)驗(yàn)室能夠滿足一定的凈化要求。其中，排氣系統(tǒng)是保證實(shí)驗(yàn)室相對(duì)負(fù)壓環(huán)境有效過(guò)濾室內(nèi)污染排放的重點(diǎn)。