由于生物有機(jī)肥和精制有機(jī)肥在商品形態(tài)上區(qū)別不大，加之一些廠家的夸大宣傳，給廣大農(nóng)民和一些經(jīng)銷(xiāo)商造成概念上的混淆。其實(shí)，生物有機(jī)肥和精制有機(jī)肥是有本質(zhì)區(qū)別的。

　　一、考量指標(biāo)不同。生物有機(jī)肥以有效活菌數(shù)和有機(jī)質(zhì)為考量指標(biāo)，而精制有機(jī)肥只考量有機(jī)質(zhì)。簡(jiǎn)單說(shuō)，生物有機(jī)肥含菌，精制有機(jī)肥不含菌。

　　第二、管理權(quán)限不同。生物有機(jī)肥的管理、發(fā)證機(jī)關(guān)為國(guó)家部，只有獲得農(nóng)部微生物肥料登記證的生物有機(jī)肥才允許生產(chǎn)、銷(xiāo)售和使用；精制有機(jī)肥的管理、發(fā)證機(jī)關(guān)為省級(jí)農(nóng)業(yè)主管部門(mén)。這是區(qū)別生物有機(jī)肥和精制有機(jī)肥很直接的方法。

　　第三、生產(chǎn)工藝不同。生物有機(jī)肥是在發(fā)酵腐熟的有機(jī)肥中加入有益菌制成的，生產(chǎn)工藝的核心是均種的發(fā)酵培養(yǎng)，培養(yǎng)結(jié)果要使產(chǎn)品中的有效活菌數(shù)達(dá)到農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的要求，即每克2000萬(wàn)個(gè)以上，否則就是不合格產(chǎn)品。中國(guó)化肥生產(chǎn)中氮磷鉀比例失調(diào)，中國(guó)耕地有近3億畝缺鉀，10億畝缺磷。而精制有機(jī)肥的生產(chǎn)工藝僅僅是有機(jī)肥的腐熟。

減少化肥的使用量和提高作物品質(zhì)使用微生物肥料后對(duì)于提高農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)，如蛋白質(zhì)、糖分、維生素等的含量上有一定作用，有的可以減少肖酸鹽的積累。在有些情況下，品質(zhì)的改善比產(chǎn)量提高好處更大。有機(jī)肥料有機(jī)肥料（manure） 天然有機(jī)質(zhì)經(jīng)微生物分解或發(fā)酵而成的一類肥料。中國(guó)又稱農(nóng)家肥。果樹(shù)用根據(jù)樹(shù)體大小和結(jié)果量的多少掌握施肥量，樹(shù)體大、結(jié)果多，應(yīng)多施。其特點(diǎn)有：原料來(lái)源廣，數(shù)量大；養(yǎng)分全，含量低；肥效遲而長(zhǎng)，須經(jīng)微生物分解轉(zhuǎn)化后才能為植物所吸收；改土培肥效果好。常用的自然肥料品種有綠肥、人糞尿、廄肥、堆肥、漚肥、沼氣肥和廢棄物肥料等。

中國(guó)每年各種有機(jī)肥料總生產(chǎn)量達(dá)18～24億噸，其中氮磷鉀養(yǎng)分含量就有1678萬(wàn)噸。這些數(shù)字只是粗略的估算。隨著人口的增加，農(nóng)業(yè)、畜牧業(yè)生產(chǎn)的發(fā)展，人民生活水平的提高，有機(jī)肥料的數(shù)量和質(zhì)量都有很大的變化。據(jù)1998中國(guó)農(nóng)業(yè)年鑒統(tǒng)計(jì)中國(guó)人口為12.058億，是1989的1.062倍，增加1.023億人；糧食產(chǎn)量為4.942億噸，是1989的1.12倍，增加7975萬(wàn)噸，豬、牛、羊出欄數(shù)為63722.1萬(wàn)頭，是1989年的1.673倍，增加2.5633億頭。禽蛋產(chǎn)量2125.4萬(wàn)噸是1989年的2.95倍，增加1405.6萬(wàn)噸。硅肥的施入可減少磷在土壤中的固定，活化土壤中固定態(tài)磷，并促進(jìn)磷在植物體內(nèi)的元轉(zhuǎn)，從而提高利用率。人口、畜禽數(shù)量和糧食產(chǎn)量的增加，必然增加人、畜、禽糞便和作物秸稈的數(shù)量。因此中國(guó)各種有機(jī)肥料年總生產(chǎn)量可能要遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)18～24億噸，其中氮磷鉀養(yǎng)分含量也要超過(guò)1678萬(wàn)噸。據(jù)國(guó)家的預(yù)測(cè)20世紀(jì)末，中國(guó)有機(jī)肥中氮磷鉀養(yǎng)分總量達(dá)1971～2087±91.7萬(wàn)噸。總之中國(guó)的有機(jī)肥料是一項(xiàng)數(shù)量巨大的資源，而且是每年持續(xù)不斷地生產(chǎn)出來(lái)的，利用好了將成為發(fā)展農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的物質(zhì)保證。

人糞尿人體排泄的尿和糞的混合物。人糞約含70%～80%水分，20%的有機(jī)質(zhì)（纖維類、脂肪類、蛋白質(zhì)和硅、磷、鈣、鎂、鉀、鈉等鹽類及綠化物），少量糞臭質(zhì)、糞膽質(zhì)和色素等。人尿含水分和尿素、鹽、尿酸、馬尿酸、磷酸鹽、銨鹽、微量元素及生長(zhǎng)素等。人糞尿中常混有病菌和蟲(chóng)卵，施前應(yīng)進(jìn)行無(wú)害化處理，以免污染環(huán)境。人糞尿碳氮比（C/N）較低，極易分解；含氮素較多，腐熟后可作速氮肥用，作基肥或追肥均可，宜與磷、鉀肥配合施用。3、精制有機(jī)肥肥效長(zhǎng)，施一季管一年，能促進(jìn)土壤供肥持久，使作物后期不早衰。但不能與堿性肥料（草木灰、石灰）混用；每次用量不宜過(guò)多；旱地應(yīng)加水稀釋，施后復(fù)土；水田應(yīng)結(jié)合耕田，淺水勻潑，以免揮發(fā)、流失和使作物徒長(zhǎng)。忌綠作物不宜用，以免影響品質(zhì)。