目前，我國微生物肥料生產(chǎn)仍存在活菌數(shù)低、品種少、效果不穩(wěn)定、成本和價格較高的問題。此外，該行業(yè)存在著大量的善惡混雜、不均衡和知識產(chǎn)權(quán)的現(xiàn)象，這也在一定程度上影響了微生物肥料的產(chǎn)業(yè)化進程，削弱了農(nóng)民施用微生物肥料的積極性。此外，微生物肥料的生產(chǎn)需要先進的機械設(shè)備，具備一定規(guī)模的工業(yè)生產(chǎn)條件(如造粒設(shè)備、干燥設(shè)備等)。)。只有開發(fā)生產(chǎn)微生物肥料機械設(shè)備，才能有效促進微生物肥料加工業(yè)的發(fā)展，為市場提供大量微生物肥料。

微生物具有凈化土壤的功能。微生物可以降解殘留在土壤中的有機農(nóng)業(yè)廢棄物、城市垃圾和工廠垃圾。微生物將它們分解成低危害甚至無害的物質(zhì)，以減少殘留的危害。當然，所有這些功能都是由不同的微生物群執(zhí)行的，而每個功能的實現(xiàn)需要大量的微生物共同工作。微生物可以提高作物的無彝能力。不同類型的微生物具有不同的功能，如微生物，可以分泌素，抑制病原微生物的繁殖，從而預防和減少土傳病害微生物對作物的危害，提高作物的產(chǎn)量和品質(zhì)。在土壤上進行“去毒”和“保健”，以調(diào)節(jié)和保持土壤的健康質(zhì)量。如今，當土壤退化、作物質(zhì)量下降和化肥減少時，微生物在改良土壤和提高肥料效率方面具有的功能。

微生物在繁殖和代謝過程中能夠降解土壤中殘留的肥料、有機農(nóng)業(yè)肥料、重金屬等污染物，在物理化學反應中分解、轉(zhuǎn)化、固定、轉(zhuǎn)移和新的無害合成上述污染物，并將其分解為低危害甚至無害的物質(zhì)，從而降低土壤污染程度。微生物肥料具有溶解磷、鉀、氮的功能，促進土壤中微量元素的釋放和螯合，可提高肥料利用率10% ~ 30%。在一定條件下，它還能參與腐殖質(zhì)的形成，有利于提高土壤肥力。應用:由于微生物肥料細菌活躍，施用方法比化肥和有機肥更嚴格。因此，應注意:，避免開袋后長期使用。買回來肥料后，盡快把它涂在地上，打開袋子后盡快用完。