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PCR的創(chuàng)建
Khorana (1971)等zui早提出核酸體外擴增的設想:“經(jīng)DNA變性,與合適的引物雜交,用DNA聚合酶延伸引物,并不斷重復該過程便可合成tRNA基因。”但由于當時基因序列分析方法尚未成熟,熱穩(wěn)定DNA聚合酶尚未報道以及引物合成的困難,這種想法似乎沒有實際意義。加上分子克1隆技術的出現(xiàn)提供了一種克1隆和擴增基因的途徑,所以Khorana的設想被人們遺忘了。
1983年4月的一個星期五晚上,他開車去鄉(xiāng)下別墅的路上,猛然閃現(xiàn)出“多聚酶鏈式反應”的想法。
1983年12月,Mullis用同位素標記法看到了10個循環(huán)后的49 bp長度的第yi個PCR片段;
1985年,Kary Mullis在Cetus公司工作期間,發(fā)明了PCR。Mullis要合成DNA引物來進行測序工作,卻常為沒有足夠多的模板DNA而煩惱。
1985年10月25日申請了PCR的專1利,
1987年7月28日批準(專1利號4,683,202 ),Mullis是第yi個發(fā)明人;
1985年12月20日在Science雜志上發(fā)表了第yi篇PCR的學術論1文,Mullis是共同作者;
1986年5月,Mullis在冷泉港實驗室做專題報告,全世界從此開始學習PCR的方法。
反向PCR( Inverse PCR, IPCR術
原理:反向PCR是克1隆已知序列旁側序列的一種方法,主要原理是用一種在已知序列中無切點的限制性內(nèi)切酶消化基因組DNA.后酶切片段自身環(huán)化.以環(huán)化的DNA作為模板,用一對與已知序列兩端特異性結合的引物,擴增夾在中間的未知序列。該擴增產(chǎn)物是線性的DNA的部分片段,大小取決于.上述限制性內(nèi)切酶在已知基閑側翼DNA序列內(nèi)部的酶切位點分布情況。用不同的限制性內(nèi)切酶消化,可以得到大小不同的模板DNA,再通過反向PCR獲得未知片段。
該方法的不足是:①需要從許多酶中選擇限制酶,或者說必須選擇一種合適的酶進行酶切才能得到合理大小的DNA部分片段。這種選擇不能在非酶切位點切斷靶DNA。②大多數(shù)有核基因組含有大量中度和高度重復序列,而在YAC或Cosmid中的未知功能序列中有時也會有這些序列,這樣,通過反向PCR得到的探針就有可能與多個基因序列雜交。
巢式PCR(NEST PCR枝術.
先用一對靶序列的外引物擴增以提高模板量.然后再用一對內(nèi)引物擴增以得到特異的PCR帶。此為巢式PCR。若用一條外引物作內(nèi)引物則稱之為半巢式PCR。為減少 巢式PCR的操作步驟可將外引物設計得比內(nèi)引物長些,且用量較少。同時在第yi次PCR時采用較高的退火溫度而第二次采用較低的退火溫度。這樣在第yi次PCR時,由于較高退火溫度下內(nèi)引物不能與模板結合,故只有外引物擴增產(chǎn)物,經(jīng)過若干次循環(huán)。待外引物基本消耗盡,無需取出第yi次PCR產(chǎn)物,只需降低退火即可直接進行PCR擴增。這不僅減少操作步驟。同時也降低了交叉污染的機會。這種PCR稱中途進退式PCR( drop-in, drop-out PCR)上述三種方法主要用于少量DNA模板的擴增。