研發(fā)項目界定應(yīng)吻合《重點(diǎn)支持技術(shù)領(lǐng)域》（詳見《高企認(rèn)定管理辦法》），從而歸納選定本企業(yè)申報高企的技術(shù)領(lǐng)域。研發(fā)項目所研發(fā)的技術(shù)目標(biāo)既要體現(xiàn)行業(yè)先進(jìn)性，也要結(jié)合企業(yè)實(shí)際。每年評審都否定一部分企業(yè)的低水平研發(fā)項目或編造不切實(shí)際的“前沿高水平”項目，項目對應(yīng)的研發(fā)費(fèi)用、成果轉(zhuǎn)化也被剔除。如果企業(yè)在同一年度通過培育入庫和出庫的，還可同時享受入庫獎補(bǔ)和出庫獎補(bǔ)。

認(rèn)定機(jī)構(gòu)收到的評價意見和中介機(jī)構(gòu)的專項審計報告后，對申請企業(yè)提出認(rèn)定意見，并確定高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定名單。企業(yè)申請認(rèn)定時須注冊成立一年以上（“須注冊成立一年以上”是指企業(yè)須注冊成立365個日歷天數(shù)以上，而非一個會計年度）。研發(fā)組織管理水平證明材料，主要包括研發(fā)項目立項管理、研發(fā)投入核算體系、研發(fā)機(jī)構(gòu)建設(shè)及設(shè)備設(shè)施、開展產(chǎn)學(xué)研合作活動、研發(fā)人員考核制度等方面；技術(shù)創(chuàng)新活動的其他證明材料。

在高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定過程中所指的企業(yè)總收入也是有一定界定的，指的是企業(yè)的收入總額減去不征稅的收入，具體按照國家相關(guān)法律法規(guī)的規(guī)定計算。在提交《高新認(rèn)定申請書》前企業(yè)必須認(rèn)真核查5份審計報告數(shù)據(jù)和申報系統(tǒng)中提交的數(shù)據(jù)的一致性，如果對不上要及時處理更正不然會不予通過。鼓勵企業(yè)吸引人才，建立研發(fā)機(jī)構(gòu)，建立健全 研發(fā)組織管理制度，加大研發(fā)投入，引導(dǎo)企業(yè)自主研發(fā)創(chuàng)新，擁有相應(yīng)的知 識產(chǎn)權(quán)所有權(quán)，提升企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新能力和創(chuàng)新水平。

在提交《高新認(rèn)定申請書》前企業(yè)必須認(rèn)真核查5份審計報告數(shù)據(jù)和申報系統(tǒng)中提交的數(shù)據(jù)的一致性，如果對不上要及時處理更正不然會不予通過。很多科技項目都需要在具備高新技術(shù)企業(yè)資質(zhì)的基礎(chǔ)上申報。如中小企業(yè)科技扶持資金等項目類；如工程技術(shù)研究中心等認(rèn)定類。在高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定過程中要求企業(yè)技術(shù)產(chǎn)品或者服務(wù)的收入占企業(yè)總收入的60%，這里的收入當(dāng)然不是說都是產(chǎn)品的收入，還有其他的跟核心技術(shù)或者知識產(chǎn)權(quán)的收入也算在其中。