由于生物有機(jī)肥和精制有機(jī)肥在商品形態(tài)上區(qū)別不大，加之一些廠家的夸大宣傳，給廣大農(nóng)民和一些經(jīng)銷(xiāo)商造成概念上的混淆。其實(shí)，生物有機(jī)肥和精制有機(jī)肥是有本質(zhì)區(qū)別的。

　　一、考量指標(biāo)不同。生物有機(jī)肥以有效活菌數(shù)和有機(jī)質(zhì)為考量指標(biāo)，而精制有機(jī)肥只考量有機(jī)質(zhì)。簡(jiǎn)單說(shuō)，生物有機(jī)肥含菌，精制有機(jī)肥不含菌。

　　第二、管理權(quán)限不同。生物有機(jī)肥的管理、發(fā)證機(jī)關(guān)為國(guó)家部，只有獲得農(nóng)部微生物肥料登記證的生物有機(jī)肥才允許生產(chǎn)、銷(xiāo)售和使用；精制有機(jī)肥的管理、發(fā)證機(jī)關(guān)為省級(jí)農(nóng)業(yè)主管部門(mén)。這是區(qū)別生物有機(jī)肥和精制有機(jī)肥很直接的方法。

　　第三、生產(chǎn)工藝不同。生物有機(jī)肥是在發(fā)酵腐熟的有機(jī)肥中加入有益菌制成的，生產(chǎn)工藝的核心是均種的發(fā)酵培養(yǎng)，培養(yǎng)結(jié)果要使產(chǎn)品中的有效活菌數(shù)達(dá)到農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的要求，即每克2000萬(wàn)個(gè)以上，否則就是不合格產(chǎn)品。而精制有機(jī)肥的生產(chǎn)工藝僅僅是有機(jī)肥的腐熟。所以歸根結(jié)底，化肥“使土壤板結(jié)”的面作用并不是化肥之過(guò)，而是人們忽視了向土壤施用足量的有機(jī)肥料的結(jié)果。

據(jù)中國(guó)農(nóng)業(yè)年鑒1990年資料，中國(guó)存欄數(shù)約3.4億頭，牛近1億頭，馬騾驢2700萬(wàn)匹，這些家畜排泄物數(shù)量大，養(yǎng)分豐富，是中國(guó)農(nóng)村大的有機(jī)肥資源。其中豬每年可為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)提供氮素130多萬(wàn)噸，磷素85萬(wàn)噸，鉀素180萬(wàn)噸；氮磷鉀主導(dǎo)我國(guó)肥料市場(chǎng)，新型肥料應(yīng)運(yùn)而生我國(guó)化肥產(chǎn)業(yè)自1949年開(kāi)始迅速發(fā)展，發(fā)展順序是先氮肥、后磷肥、再鉀肥、復(fù)合（混）肥，常規(guī)化肥品種的發(fā)展趨勢(shì)基本遵循著世界化肥產(chǎn)業(yè)發(fā)展的主流趨勢(shì)，即向高濃度和復(fù)合化方向邁進(jìn)。大牲畜可提供氮160多萬(wàn)噸，磷83萬(wàn)噸，鉀110多萬(wàn)噸。加上每年有30多億只家禽和10多億只兔，其提供的養(yǎng)分量占農(nóng)村有機(jī)肥料總量的63%～72%。

廢棄物肥料以廢棄物和生物有機(jī)殘?bào)w為主的肥料。其種類(lèi)有：生活垃圾；生活污水；中國(guó)習(xí)慣使用的有人畜禽糞尿、綠肥、廄肥、堆肥、漚肥和沼氣肥等。屠宰場(chǎng)廢棄物；海肥（沿海地區(qū)動(dòng)物、植物性或礦物性物質(zhì)構(gòu)成的地方性肥料）。天然礦物質(zhì)肥礦物質(zhì)肥，包括鉀礦粉、磷礦粉、氯化鈣、天然硫酸鉀鎂肥等沒(méi)有經(jīng)過(guò)化學(xué)加工的天然物質(zhì)。此類(lèi)產(chǎn)品要通過(guò)有機(jī)認(rèn)證，并嚴(yán)格按照有機(jī)標(biāo)準(zhǔn)生產(chǎn)才可用于有機(jī)農(nóng)業(yè)。另外值得一提的是，在補(bǔ)鉀方面可選用取得有機(jī)產(chǎn)品認(rèn)證的中信國(guó)安“有機(jī)天然硫酸鉀鎂肥”，該鉀肥填補(bǔ)了有機(jī)天然礦物肥的國(guó)內(nèi)空白，解決了有機(jī)農(nóng)業(yè)補(bǔ)鉀難的問(wèn)題。

單施有機(jī)肥3500～7000公斤，9年后土壤有機(jī)碳提高0.04%～0.16%，容重降低0.04～0.06克/厘米3，總孔隙度提高1.5%～2.3%，毛管孔隙度提高3.45%～4.05%，田間持水量提高1.13%～1.31%。配合施用氮9.2～18.4公斤的尿素后，上述各項(xiàng)指標(biāo)比單施有機(jī)肥處理明顯提高。有機(jī)碳比對(duì)照提高0.09%～0.19%，容重降低0.03～0.1克/厘米3，總孔隙度提高1.1%～3.8%，毛管孔隙度提高3.45%～5.0%，田間持水量提高2.49%～4.24%。但是使用有機(jī)肥料也有存在養(yǎng)分含量低，不易分解，不能及時(shí)滿(mǎn)足作物高產(chǎn)的要求。