高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定的程序如下:

(一)企業(yè)自我評價及申請

企業(yè)登錄"高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)"，對照本辦法第十條規(guī)定條件，進行自我評價。認(rèn)為符合認(rèn)定條件的，企業(yè)可向認(rèn)定機構(gòu)提出認(rèn)定申請。

(二)提交下列申請材料

1. 高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定申請書;

2. 企業(yè)營業(yè)執(zhí)照副本、稅務(wù)登記證(復(fù)印件);

3. 知識產(chǎn)權(quán)證書(獨占許可合同)、生產(chǎn)批文，新產(chǎn)品或新技術(shù)證明(查新)材料、產(chǎn)品質(zhì)量檢驗報告、省級以上科技計劃立項證明，以及其他相關(guān)證明材料;

為扶持和鼓勵高新技術(shù)企業(yè)的發(fā)展，根據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》(以下稱《企業(yè)所得稅法》)、《中華人民共和國企業(yè)所得稅法實施條例》(以下稱《實施條例》)有關(guān)規(guī)定，制定本辦法。

健全內(nèi)部控制制度

確保研究開發(fā)費用核算歸集的真實、準(zhǔn)確。企業(yè)應(yīng)按月對包括直接研究開發(fā)活動和可以計入的間接研究開發(fā)活動所發(fā)生的費用進行歸集，并填寫企業(yè)年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細(xì)表。對研究開發(fā)部門的各項費用建立輔助賬冊，進行單獨核算。(四)選擇參與高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定工作的專家并報領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室備案。具體來講應(yīng)建立如下控制制度 。

折疊建立人工費用控制制度

員工的錄用、辭退應(yīng)經(jīng)過研究開發(fā)項目相關(guān)負(fù)責(zé)人批準(zhǔn)，并編制研發(fā)人員名冊，準(zhǔn)確核算人員費用。研究開發(fā)項目管理部門統(tǒng)計工時，負(fù)責(zé)工資計算的部門依據(jù)研究開發(fā)項目管理部門統(tǒng)計的工時和規(guī)定的工資標(biāo)準(zhǔn)制作工資表。企業(yè)應(yīng)按月對包括直接研究開發(fā)活動和可以計入的間接研究開發(fā)活動所發(fā)生的費用進行歸集，并填寫企業(yè)年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細(xì)表。研發(fā)人員的工資表經(jīng)過研究開發(fā)項目有關(guān)負(fù)責(zé)人簽署后報財務(wù)部門發(fā)放工資，財務(wù)部門依據(jù)各研究開發(fā)項目的工時統(tǒng)計計算各項目的工資費用。

建立材料工裝準(zhǔn)備控制制度

財務(wù)部門在每月的月底處理完所有的研究開發(fā)項目的領(lǐng)料單、出庫單。財務(wù)部門和研發(fā)部門每月核對領(lǐng)料情況，財務(wù)部門作為研發(fā)費用記賬依據(jù)的原材料領(lǐng)用單必須經(jīng)過研發(fā)部門有關(guān)負(fù)責(zé)人簽署。研發(fā)人員的工資表經(jīng)過研究開發(fā)項目有關(guān)負(fù)責(zé)人簽署后報財務(wù)部門發(fā)放工資，財務(wù)部門依據(jù)各研究開發(fā)項目的工時統(tǒng)計計算各項目的工資費用。財務(wù)部門依據(jù)各研究開發(fā)項目的工裝準(zhǔn)備費用單據(jù)計算各項目的工裝準(zhǔn)備費用。