由于生物有機(jī)肥和精制有機(jī)肥在商品形態(tài)上區(qū)別不大，加之一些廠家的夸大宣傳，給廣大農(nóng)民和一些經(jīng)銷商造成概念上的混淆。其實，生物有機(jī)肥和精制有機(jī)肥是有本質(zhì)區(qū)別的。

　　一、考量指標(biāo)不同。生物有機(jī)肥以有效活菌數(shù)和有機(jī)質(zhì)為考量指標(biāo)，而精制有機(jī)肥只考量有機(jī)質(zhì)。簡單說，生物有機(jī)肥含菌，精制有機(jī)肥不含菌。

　　第二、管理權(quán)限不同。生物有機(jī)肥的管理、發(fā)證機(jī)關(guān)為國家部，只有獲得農(nóng)部微生物肥料登記證的生物有機(jī)肥才允許生產(chǎn)、銷售和使用；精制有機(jī)肥的管理、發(fā)證機(jī)關(guān)為省級農(nóng)業(yè)主管部門。這是區(qū)別生物有機(jī)肥和精制有機(jī)肥很直接的方法。

　　第三、生產(chǎn)工藝不同。穩(wěn)定化處理是指通過生物降解已將物料中易被微生物降解的有機(jī)成分，如可溶性有機(jī)物、淀粉、蛋白質(zhì)等轉(zhuǎn)化為相對穩(wěn)定的有機(jī)物，不會對植物種子和作物苗期生長產(chǎn)生不利的影響。生物有機(jī)肥是在發(fā)酵腐熟的有機(jī)肥中加入有益菌制成的，生產(chǎn)工藝的核心是均種的發(fā)酵培養(yǎng)，培養(yǎng)結(jié)果要使產(chǎn)品中的有效活菌數(shù)達(dá)到農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的要求，即每克2000萬個以上，否則就是不合格產(chǎn)品。而精制有機(jī)肥的生產(chǎn)工藝僅僅是有機(jī)肥的腐熟。

生物肥料（微生物肥料）的種類較多，按照制品中特定的微生物種類可分為菌肥料（如根瘤菌肥、固氮菌肥）、線菌肥料（如抗生菌肥料）、菌類肥料（如菌根菌）；按其作用機(jī)理分為根瘤菌肥料、固氮菌肥料（自生或聯(lián)合共生類）、解磷菌類肥料、硅酸鹽菌類肥料；按其制品內(nèi)含分為單一的微生物肥料和復(fù)合（或復(fù)混）微生物肥料。生物有機(jī)肥的管理、發(fā)證機(jī)關(guān)為國家部，只有獲得農(nóng)部微生物肥料登記證的生物有機(jī)肥才允許生產(chǎn)、銷售和使用。復(fù)合微生物肥料又有菌、菌復(fù)合，也有菌和各種添加劑復(fù)合的。

生物肥料的作用：生物肥料（微生物肥料）的功效是一種綜合作用，主要是與營養(yǎng)元素的來源和有效性有關(guān)，或與作物吸收營養(yǎng)、水分和抗?。ㄏx）有關(guān)?？傮w來說，生物肥料（微生物肥料）的作用為以下幾點：1．增進(jìn)土壤肥力施用固氮微生物肥料，可以增加土壤中的氮素來源；解磷、解鉀微生物肥料，可以將土壤中難溶的磷、鉀分解出來，轉(zhuǎn)變?yōu)樽魑锬芪绽玫牧?、鉀化合物，改善作物的營養(yǎng)條件。任何一種元素的缺少都會影響到作物的正常生長發(fā)育，例如，缺氮會導(dǎo)致植株矮小細(xì)弱，葉呈黃綠、黃橙等非正常綠色，嚴(yán)重缺氮時，作物顯著早衰并早熟，產(chǎn)量顯著下降，只有通過增施氮肥，才能減輕其危害。2．制造和協(xié)助農(nóng)作物吸收營養(yǎng)根瘤菌侵染豆科植物根部，固定空氣中的氮素。微生物在繁殖中能產(chǎn)生大量的植物生長素，刺激和調(diào)節(jié)作物生長，使植株生長健壯，促進(jìn)對營養(yǎng)元素的吸收。3．增強(qiáng)植物抗病和抗旱能力微生物肥料由于在作物根部大量生長繁殖，抑制或減少了病原微生物的繁殖機(jī)會；抗病原微生物的作用，減輕作物的病害；微生物大量生長，菌絲能增加對水分的吸收，使作物抗旱能力提高。

有機(jī)肥料亦稱“農(nóng)家肥料”。凡以有機(jī)物質(zhì)(含有碳元素的化合物) 作為肥料的均稱為有機(jī)肥料。但是使用有機(jī)肥料也有存在養(yǎng)分含量低，不易分解，不能及時滿足作物高產(chǎn)的要求。包括人糞尿、廄肥、堆肥、綠肥、餅肥、沼氣肥等。具有種類多、來源廣、肥效較長等特點。有機(jī)肥料所含的營養(yǎng)元素多呈有機(jī)狀態(tài)，作物難以直接利用，經(jīng)微生物作用，緩慢釋放出多種營養(yǎng)元素，源源不斷地將養(yǎng)分供給作物。施用有機(jī)肥料能改善土壤結(jié)構(gòu)，有效地協(xié)調(diào)土壤中的水、肥、氣、熱，提高土壤肥力和土地生產(chǎn)力。