認(rèn)定機構(gòu)收到的評價意見和中介機構(gòu)的專項審計報告后，對申請企業(yè)提出認(rèn)定意見，并確定高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定名單。企業(yè)申請認(rèn)定時須注冊成立一年以上（“須注冊成立一年以上”是指企業(yè)須注冊成立365個日歷天數(shù)以上，而非一個會計年度）。研發(fā)組織管理水平證明材料，主要包括研發(fā)項目立項管理、研發(fā)投入核算體系、研發(fā)機構(gòu)建設(shè)及設(shè)備設(shè)施、開展產(chǎn)學(xué)研合作活動、研發(fā)人員考核制度等方面；技術(shù)創(chuàng)新活動的其他證明材料。

日常要做好研發(fā)項目檔案管理，包括研發(fā)項目立項報告、中期檢查報告紀(jì)要、結(jié)題報告、測試報告等。高企認(rèn)定申報時候上傳相關(guān)文檔作為附件證明項目真實性、先進(jìn)性和管理規(guī)范性的證明。企業(yè)從事研發(fā)和相關(guān)技術(shù)創(chuàng)新活動的科技人員占企業(yè)當(dāng)年職工總數(shù)的比例不低于10%，其中大專以上學(xué)歷的科技人員占全部科技人員人數(shù)的30%以上。如果企業(yè)在同一年度通過培育入庫和出庫的，還可同時享受入庫獎補和出庫獎補。

企業(yè)除了在網(wǎng)上進(jìn)行填報資料外還需要到窗口提交紙質(zhì)材料，這樣高新企業(yè)申報了復(fù)審的程序才可以進(jìn)行。創(chuàng)新是企業(yè)發(fā)展的根本動力，高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定政策是一項引導(dǎo)政策，目的是引導(dǎo)企業(yè)調(diào)整產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)，走自主創(chuàng)新、持續(xù)創(chuàng)新的發(fā)展道路，激發(fā)企業(yè)自主創(chuàng)新的熱情，提高科技創(chuàng)新能力。企業(yè)通過自主研發(fā)、受讓、受贈、并購等方式，獲得對其主要產(chǎn)品（服務(wù)）在技術(shù)上發(fā)揮核心支持作用的知識產(chǎn)權(quán)的所有權(quán)。

高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定所指的知識產(chǎn)權(quán)須在中國境內(nèi)授權(quán)或?qū)徟鷮彾ǎ⒃谥袊傻挠行ПＷo(hù)期內(nèi)。知識產(chǎn)權(quán)權(quán)屬人應(yīng)為申請企業(yè)。證明企業(yè)在本領(lǐng)域中具有較強的技術(shù)創(chuàng)新能力、技術(shù)開發(fā)能力，有利于企業(yè)開拓國內(nèi)外市場。在提交《高新認(rèn)定申請書》前企業(yè)必須認(rèn)真核查5份審計報告數(shù)據(jù)和申報系統(tǒng)中提交的數(shù)據(jù)的一致性，如果對不上要及時處理更正不然會不予通過。